28 KiB
Отчёт по лабораторной работе №2
по теме: "Обнаружение аномалий"
Выполнили: Бригада 2, Мачулина Д.В., Бирюкова А.С., А-02-22
Данные - WBC
Задание 1
1. Создание блокнота и настройка среды
from google.colab import drive
drive.mount('/content/drive')
import os
os.chdir('/content/drive/MyDrive/Colab Notebooks/is_lab2')
import numpy as np
import lab02_lib as lib
work_dir = '/content/drive/MyDrive/Colab Notebooks/is_lab2'
os.makedirs(work_dir, exist_ok=True)
os.chdir(work_dir)
os.makedirs('out', exist_ok=True)
dataset_name = 'WBC'
base_url = "http://uit.mpei.ru/git/main/is_dnn/raw/branch/main/labworks/LW2/"
!wget -N {base_url}lab02_lib.py
!wget -N {base_url}data/{dataset_name}_train.txt
!wget -N {base_url}data/{dataset_name}_test.txt
2. Генерация индивидуального набора двумерных данных
data = lib.datagen(2, 2, 1000, 2)
print('Исходные данные:')
print(data)
print('Размерность данных:')
print(data.shape)
| Исходные данные | |
|---|---|
| 1.9863081 | 1.86491133 |
| 2.04641244 | 1.8589354 |
| 1.89688572 | 1.89978633 |
| ... | |
| 1.99310837 | 2.06214288 |
| 1.94695115 | 1.99630611 |
| 1.79129354 | 1.91688919 |
Размерность данных: (1000, 2)
3. Создание и обучение автокодировщика АЕ1 простой архитектуры
patience = 300
ae1_trained, IRE1, IREth1 = lib.create_fit_save_ae(data,'out/AE1.h5','out/AE1_ire_th.txt',
1000, True, patience)
Параметры: (1 скрытый слой, 1 нейрон)
4. Построение графика ошибки реконструкции
Ошибка MSE_AE1 = 0.1370
lib.ire_plot('training', IRE1, IREth1, 'AE1')
Порог ошибки реконструкции = 0.81
5. Создание и обучение автокодировщика АЕ2 усложнённой архитектуры
ae2_trained, IRE2, IREth2 = lib.create_fit_save_ae(data,'out/AE2.h5','out/AE2_ire_th.txt',
3000, True, patience)
Параметры: (5 скрытых слоёв; 3 2 1 2 3)
6. Построение графика ошибки реконструкции
Ошибка MSE_AE2 = 0.0094
lib.ire_plot('training', IRE2, IREth2, 'AE2')
Порог ошибки реконструкции = 0.38
7. Расчёт характеристик качества обучения EDCA. Визуализация и сравнение
АЕ1
numb_square = 20
xx, yy, Z1 = lib.square_calc(numb_square, data, ae1_trained, IREth1, '1', True)
amount: 19
amount_ae: 104
Оценка качества AE1
-
IDEAL = 0. Excess: 4.473684210526316
-
IDEAL = 0. Deficit: 0.0
-
IDEAL = 1. Coating: 1.0
-
summa: 1.0
-
IDEAL = 1. Extrapolation precision (Approx): 0.18269230769230768
АЕ2
numb_square = 20
xx, yy, Z2 = lib.square_calc(numb_square, data, ae2_trained, IREth2, '2', True)
amount: 19
amount_ae: 31
Оценка качества АЕ2
- IDEAL = 0. Excess: 0.631578947368421
- IDEAL = 0. Deficit: 0.0
- IDEAL = 1. Coating: 1.0
- summa: 1.0
- IDEAL = 1. Extrapolation precision (Approx): 0.612903225806
Сравнение
lib.plot2in1(data, xx, yy, Z1, Z2)
8. Редактирование автокодировщика АЕ2
Полученная аппроксимация автокодировщиком АЕ2 - удовлетворительна.
9. Создание тестовой выборки и применение к ней автокодировщиков
with open('data_test.txt', 'w') as file:
file.write("1.5327 1.5591\n")
file.write("1.4373 1.4932\n")
file.write("1.1231 1.3212\n")
file.write("1.3211 1.1231\n")
data_test = np.loadtxt('data_test.txt', dtype=float)
print(data_test)
АЕ1
predicted_labels1, ire1 = lib.predict_ae(ae1_trained, data_test, IREth1)
lib.anomaly_detection_ae(predicted_labels1, ire1, IREth1)
lib.ire_plot('test', ire1, IREth1, 'AE1')
Аномалий не обнаружено
АЕ2
predicted_labels2, ire2 = lib.predict_ae(ae2_trained, data_test, IREth2)
lib.anomaly_detection_ae(predicted_labels2, ire2, IREth2)
lib.ire_plot('test', ire2, IREth2, 'AE2')
| i | labels | IRE | IREth |
|---|---|---|---|
| 0 | [1.] | [0.57] | 0.38 |
| 1 | [1.] | [0.68] | 0.38 |
| 2 | [1.] | [1.03] | 0.38 |
| 3 | [1.] | [1.04] | 0.38 |
Обнаружено 4.0 аномалий
10. Визуализация элементов обучающей и тестовой выборки в областях пространства признаков
lib.plot2in1_anomaly(data, xx, yy, Z1, Z2, data_test)
11. Результаты
| Количество скрытых слоёв | Количество нейронов в скрытых слоях | Количество эпох обучения | Ошибка MSE_stop | Порог ошибки реконструкции | Значение показателя Excess | Значение показателя Approx | Количество обнаруженных аномалий | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| АЕ1 | 1 | 1 | 1000 | 0.1370 | 0.81 | 4.473 | 0.182 | 0 |
| АЕ2 | 5 | 3 2 1 2 3 | 3000 | 0.0094 | 0.38 | 0.631 | 0.612 | 4 |
Задание 2
1. Изучение набора реальных данных
Исходный набор данных Breast Cancer Wisconsin представляет собой набор данных для классификации, в котором записываются измерения для случаев рака молочной железы. Есть два класса, доброкачественные и злокачественные. Злокачественный класс этого набора данных уменьшен до 21 точки, которые считаются аномалиями, в то время как точки в доброкачественном классе считаются нормой
| Количество признаков | Количество примеров | Количество нормальных примеров | Количество аномальных примеров | |
|---|---|---|---|---|
| АЕ1 | 30 | 378 | 357 | 21 |
2. Загрузка обучающей и тестовой выборок
train = np.loadtxt('WBC_train.txt', dtype=float)
print('train:\n', train)
print('train.shape:', np.shape(train))
train:
[[3.1042643e-01 1.5725397e-01 3.0177597e-01 ... 4.4261168e-01 2.7833629e-01 1.1511216e-01]
[2.8865540e-01 2.0290835e-01 2.8912998e-01 ... 2.5027491e-01 3.1914055e-01 1.7571822e-01]
[1.1940934e-01 9.2323301e-02 1.1436666e-01 ... 2.1398625e-01 1.7445299e-01 1.4882592e-01]
... [3.3456387e-01 5.8978695e-01 3.2886463e-01 ... 3.6013746e-01 1.3502858e-01 1.8476978e-01]
[1.9967817e-01 6.6486304e-01 1.8575081e-01 ... 0.0000000e+00 1.9712202e-04 2.6301981e-02]
[3.6868759e-02 5.0152181e-01 2.8539838e-02 ... 0.0000000e+00 2.5744136e-01 1.0068215e-01]]
train.shape: (357, 30)
test = np.loadtxt('WBC_test.txt', dtype=float)
print('\n test:\n', test)
print('test.shape:', np.shape(test))
test:
[[0.18784609 0.3936422 0.19425057 0.09654295 0.632572 0.31415251 0.24461106 0.28175944 0.42171717 0.3946925 0.04530147 0.23598833 0.05018141 0.01899148 0.21589557 0.11557064 0.0655303 0.19643872 0.08003602 0.07411246 0.17467094 0.62153518 0.18332586 0.08081007 0.79066235 0.23528442 0.32132588 0.48934708 0.2757737 0.26905418]
[0.71129727 0.41224214 0.71460162 0.56776246 0.48451747 0.53990553 0.57357076 0.74602386 0.38585859 0.24094356 0.3246424 0.07507514 0.32059558 0.23047901 0.0769963 0.19495599 0.09030303 0.27865126 0.10269038 0.10023078 0.70188545 0.36727079 0.72010558 0.50181872 0.38453411 0.35044775 0.3798722 0.83573883 0.23181549 0.20136429]
...
[0.52103744 0.0226581 0.54598853 0.36373277 0.59375282 0.7920373 0.70313964 0.73111332 0.68636364 0.60551811 0.35614702 0.12046941 0.3690336 0.27381126 0.15929565 0.35139844 0.13568182 0.30062512 0.31164518 0.18304244 0.62077552 0.14152452 0.66831017 0.45069799 0.60113584 0.61929156 0.56861022 0.91202749 0.59846245 0.41886396]
[0.32367836 0.49983091 0.33542948 0.1918982 0.57389185 0.45616833 0.31794752 0.33593439 0.61363636 0.47198821 0.13166757 0.25808876 0.10446214 0.06023183 0.27082979 0.27268904 0.08777778 0.30611858 0.23158102 0.21074997 0.28744219 0.5575693 0.27685642 0.14815179 0.71471967 0.35830641 0.27004792 0.52268041 0.41119653 0.41492851]]
test.shape: (21, 30)
3. Создание и обучение автокодировщика
V1
from time import time
patience = 6500
start = time()
ae3_v1_trained, IRE3_v1, IREth3_v1 = lib.create_fit_save_ae(train,'out/AE3_V1.h5','out/AE3_v1_ire_th.txt',
60000, False, patience, early_stopping_delta = 0.001)
print("Время на обучение: ", time() - start)
Параметры: 11 скрытых слоёв; 53 47 43 35 27 13 27 35 43 47 53)
predicted_labels3_v1, ire3_v1 = lib.predict_ae(ae3_v1_trained, test, IREth3_v1)
lib.ire_plot('test', ire3_v1, IREth3_v1, 'AE3_v1')
lib.anomaly_detection_ae(predicted_labels3_v1, IRE3_v1, IREth3_v1)
| i | labels | IRE | IREth |
|---|---|---|---|
| 0 | [0.] | [0.09] | 0.67 |
| 1 | [1.] | [0.14] | 0.67 |
| 2 | [0.] | [0.14] | 0.67 |
| 3 | [0.] | [0.21] | 0.67 |
| 4 | [1.] | [0.11] | 0.67 |
| 5 | [1.] | [0.18] | 0.67 |
| 6 | [1.] | [0.13] | 0.67 |
| 7 | [1.] | [0.14] | 0.67 |
| 8 | [1.] | [0.11] | 0.67 |
| 9 | [1.] | [0.1] | 0.67 |
| 10 | [1.] | [0.14] | 0.67 |
| 11 | [1.] | [0.15] | 0.67 |
| 12 | [1.] | [0.19] | 0.67 |
| 13 | [1.] | [0.15] | 0.67 |
| 14 | [1.] | [0.19] | 0.67 |
| 15 | [1.] | [0.21] | 0.67 |
| 16 | [1.] | [0.09] | 0.67 |
| 17 | [1.] | [0.13] | 0.67 |
| 18 | [1.] | [0.55] | 0.67 |
| 19 | [1.] | [0.16] | 0.67 |
| 20 | [1.] | [1.38] | 0.67 |
Обнаружено 6.0 аномалий
V2
from time import time
patience = 5000
start = time()
ae3_v2_trained, IRE3_v2, IREth3_v2 = lib.create_fit_save_ae(train,'out/AE3_V2.h5','out/AE3_v2_ire_th.txt',
50000, False, patience, early_stopping_delta = 0.001)
print("Время на обучение: ", time() - start)
Параметры: 9 скрытых слоёв; 37 29 21 15 7 15 21 29 37)
predicted_labels3_v2, ire3_v2 = lib.predict_ae(ae3_v2_trained, test, IREth3_v2)
lib.ire_plot('test', ire3_v2, IREth3_v2, 'AE3_v2')
lib.anomaly_detection_ae(predicted_labels3_v2, IRE3_v2, IREth3_v2)
| i | labels | IRE | IREth |
|---|---|---|---|
| 0 | [0.] | [0.2] | 0.8 |
| 1 | [1.] | [0.22] | 0.8 |
| 2 | [0.] | [0.16] | 0.8 |
| 3 | [0.] | [0.3] | 0.8 |
| 4 | [0.] | [0.13] | 0.8 |
| 5 | [0.] | [0.2] | 0.8 |
| 6 | [0.] | [0.17] | 0.8 |
| 7 | [1.] | [0.15] | 0.8 |
| 8 | [0.] | [0.14] | 0.8 |
| 9 | [0.] | [0.15] | 0.8 |
| 10 | [0.] | [0.17] | 0.8 |
| 11 | [1.] | [0.14] | 0.8 |
| 12 | [0.] | [0.22] | 0.8 |
| 13 | [0.] | [0.25] | 0.8 |
| 14 | [0.] | [0.24] | 0.8 |
| 15 | [0.] | [0.29] | 0.8 |
| 16 | [0.] | [0.09] | 0.8 |
| 17 | [0.] | [0.21] | 0.8 |
| 18 | [1.] | [0.69] | 0.8 |
| 19 | [1.] | [0.16] | 0.8 |
| 20 | [0.] | [0.56] | 0.8 |
Обнаружено 5.0 аномалий
V3
from time import time
patience = 5500
start = time()
ae3_v3_trained, IRE3_v3, IREth3_v3 = lib.create_fit_save_ae(train,'out/AE3_V3.h5','out/AE3_v3_ire_th.txt',
50000, False, patience, early_stopping_delta = 0.0001)
print("Время на обучение: ", time() - start)
Параметры: 9 скрытых слоёв; 30 25 20 15 7 15 20 25 30)
predicted_labels3_v3, ire3_v3 = lib.predict_ae(ae3_v3_trained, test, IREth3_v3)
lib.ire_plot('test', ire3_v3, IREth3_v3, 'AE3_v3')
lib.anomaly_detection_ae(predicted_labels3_v3, IRE3_v3, IREth3_v3)
| i | labels | IRE | IREth |
|---|---|---|---|
| 0 | [0.] | [0.08] | 0.27 |
| 1 | [1.] | [0.11] | 0.27 |
| 2 | [0.] | [0.13] | 0.27 |
| 3 | [1.] | [0.17] | 0.27 |
| 4 | [.] | [0.13] | 0.27 |
| 5 | [1.] | [0.18] | 0.27 |
| 6 | [1.] | [0.11] | 0.27 |
| 7 | [1.] | [0.12] | 0.27 |
| 8 | [1.] | [0.11] | 0.27 |
| 9 | [1.] | [0.14] | 0.27 |
| 10 | [1.] | [0.17] | 0.27 |
| 11 | [1.] | [0.12] | 0.27 |
| 12 | [0.] | [0.11] | 0.27 |
| 13 | [1.] | [0.09] | 0.27 |
| 14 | [0.] | [0.23] | 0.27 |
| 15 | [1.] | [0.12] | 0.27 |
| 16 | [1.] | [0.1] | 0.27 |
| 17 | [0.] | [0.14] | 0.27 |
| 18 | [1.] | [0.05] | 0.27 |
| 19 | [1.] | [0.12] | 0.27 |
| 20 | [0.] | [0.1] | 0.27 |
Обнаружено 15.0 аномалий
4. Результаты
Лучшим автокодировщиком среди представленных, является AE3_V3, т.к. у него точность обнаружения аномалий наиболее высокая - 71.43%
| Dataset Name | Количество скрытых слоёв | Количество нейронов в скрытых слоях | Количество эпох обучения | Ошибка MSE_stop | Порог ошибки реконструкции | Процент обнаруженных аномалий |
|---|---|---|---|---|---|---|
| WBC | 11 | 53 47 43 35 27 13 27 35 43 47 53 | 50 000 | 0.001 | 0.67 | 28.57 |
| WBC | 9 | 37 29 21 15 7 15 21 29 37 | 50 000 | 0.0007 | 0.8 | 23.8 |
| WBC | 9 | 30 25 20 15 7 15 20 25 30 | 50 000 | 0.0005 | 0.27 | 71.43 |
ВЫВОДЫ
- Так как мы работаем с автокодировщиком, данные для его обучения должны быть без аномалий: автокодировщик должен суметь рассчитать верное пороговое значение.
- Архитектура автокодировщика представляет из себя многослойную архитектуру с сужением в середине, а также совпадающее количество входов и выходов
В первой части работы:
Оптимальным количеством скрытых слоев для нашего автокодировщика будет 5. Лучшие результаты показываются при количестве эпох - 3000 с patience в 100 эпох
- Оптимальная ошибка MSE-stop должна быть в районе 0.01, в идеале не меньше - для предотвращения переобучения. В этой работе она равна 0.0094
- Значение порога ошибки реконструкции приблизительно равно 0.38
- Значение Excess равно 0.631 (стремится к 0), значение Approx равно 0.612 (стремится к 1), количество определенных аномалий - 4, - эти результаты лучше, чем при более простой архитектуре
Во второй части работы: Сравнив разные архитектуры при работе с выборкой WBC, делаем выводы,что при неизменном количестве эпох наилучший результат показывает автокодировщик с наименьшими ошибкой MSE, порогом ошибки реконструкции и колчиеством нейронов в скрытом слое. Причинами таких результатов являются:
- При слишком высоком пороге ошибки реконструкции часть ошибок "ускользает" от автокодировщика, он не распознаёт аномалии с малой ошибкой - модель стала "консервативной"
- При большой ошибке MSE - модель недостаточно хорошо выучила нормальные данные
- При слишком большом количестве нейронов модель становится слишком сложной, она "зазубривает" данные, а не учится распознавать закономерности















